盖南共和国的下届总统候选人占士·麦佳亚前往日本访问。警视厅派遣探员出任保镖贴身保护他，可是奇怪的是还要同时保护占士的女保镖新条安奈，这里面另有什么原因？！~麦佳到达日本后，他接到一个神秘人物的恐吓电话，于是他派性感女秘书萝莎通过中介委托……

跨越神与人的分界，奔向出云的少女开始了旅途。在日本各地被称作『神无月』的10月，在出云地区被称作『神在月』的原因是——全国范围内的八百万神会在这一天销声匿迹，为了来年的结缘会议而聚集到出云。主人公是一名出生于现代的12岁少女。因为母亲去世，她讨厌着自己曾经喜欢的跑步。这是少女被神在月里转动起来的众神齿轮所带动，从而向出云奔跑的故事。邀请少女前往神域的，是一只兔子，还有一名少年。赋角色以声音的配音阵容，秉承“演员配人类，配音员配神明”“求缘”的理念，将主人公神奈的饰演者定为莳田彩珠，神使兔子的饰演者定为坂本

一位来自洛杉矶的妙龄女子竟愿意付出一百万美金雇用他们当保镖，又传出风声表示有人要暗杀城市猎人，不知道这名女子究竟是敌是友？

美树与阿香好不容易有机会参加海滩城市饭店的开幕仪式，没想到海怪和阿獠不但爽约，还意外为一个女孩子引起一场火拼。原来流亡海外的哥斯迪罗共和国的前独裁者基利阿姆将军为报复美国想利用海滩城市饭店的电脑入侵美国的战略防卫系统......

他在欧洲外籍军团待过，有十几件暗杀的案子被警方判定是他干的。此外还有绑架欧洲经济界的大人物、抢劫瑞士国际银行的运钞车的案子，他涉及的案子简直是多的数不清，可是就没有一件能够证实就是他干的，最重要的是教授并不是为了钱，而是为了他自己的美学才犯案的，这就是他被称为教授的原因！他为了把自己的过去全部抹煞掉，竟然连自己的妹妹都想杀害，他公然的向城市猎人挑战，在列车上放置炸弹，假如炸弹爆炸的话会危害到整个新宿的安全，于是城市猎人运用他的聪明，与教授展开了一场聪明之争……

当红女主播朝雾朝香聘用寒羽良做贴身保镖，良欣然接受这桩生意。然而朝雾其实另有目的。随后良即被大肆报道犯下种种罪行并被曝光在电视新闻上。而这其后的主使者又和寒羽良有着密切的关系……宿命的对决，寒羽良究竟能否化解此番险境？

来自西卡利耶拉的女钢琴师利用亲善义演机会来日本委托城市猎人猎鹰寻找亲生父亲。却意外地卷入一项可怕的情报战当中，却也因此遇上她一心想找到的父亲，没想到父亲就是地方的情报员，然而她最想知道的是父亲当年离开母亲的原因，最后阿獠及阿香给了她及父亲想要的答案.......

小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。同时间，东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。服部亦因此事，前往京都调查杀人事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期间亦发生杀人案，服部因此而受袭，和叶亦因查找施袭者线索而被人挟持。

　　早乙女研究所设计了用于宇宙开发作业用的机器人——盖塔机器人；同时，在太古时期曾一度称霸地面的爬虫人类为了重新夺回地上的世界开始了对世界各地的侵略行动。然而盖塔机器人的动力源，正是过去将爬虫人类从地面赶进地底的元凶——盖塔射线。为了阻止地上人类对盖塔射线的开发利用，恐龙帝国的统治者帝王高鲁派遣机械恐龙对早乙女研究所发起了猛烈的进攻。在首战中早乙女研究所就失去了盖塔机器人的原型试作机及以博士之子早乙女达人为首的三位测试驾驶员；在研究所陷入空前危机的情况下，幸得三名来自浅间学园的高中生——足球部的流龙马、神

人称“城市猎人”的私家侦探、地下清道夫、私人保镖和担任杀手一职的冴羽獠（Saeba Ryo又译：寒羽良）在退出江湖后终于向他的拍挡兼恋人桢村香（Makimura Kaori）求婚。但由于獠是没有正式户籍的“黑人”（非法人士），不可能和香举行真正的结婚仪式。但作为形式也为了香的心愿，獠同意和香拍张婚纱照。可就在拍婚纱照的前一天晚上，当时为了见獠而赶着回家的香在回家的路上为了救一个乱过马路的小孩而被通过十字路口的卡车撞倒。在送往医院抢救无效宣布死亡后，由于香生前填写了器官捐献卡所以把自己的心脏捐出来挽救其他人

柯南用新一的身份在电话不自愿地约会了小兰，陪她看5月3日的午夜场电影，以便请求小兰替他参加森谷帝二教授举办的茶会。柯南为此十分烦恼，不知如何掩饰他变小的事实。r柯南目送小兰离开后，为此烦恼的柯南接到一个电话，是来历不明的炸弹客挑战柯南！少年侦探团收到的引爆遥控飞机、被安装了炸弹的装小猫的篮子，还有环状线的的炸弹陷阱，大家奋力推理，才及时预防了可能发生的意外。可是，最后发现被安装了炸弹的其实是工藤新一和小兰的约会地点－米花町大楼！柯南该怎么办呢？.......

怪盗基德再度发出预告信，目标竟然是俄罗斯-罗曼诺夫王朝的皇室秘宝“记忆彩蛋”。柯南与服部联合保护“记忆彩蛋”，但把作案时间推理错误，令基德得逞，但基德于逃走中途被狙击。 自此引出一连串疑问，名侦探柯南，将于大阪解开一连串事件。

目暮警官、小兰的母亲妃英理、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑。

东京、神奈川、静冈、长野等地发生了六宗的杀人事件，由于现场留下了背面刻有字母的麻将牌，因而被认为是由同一案犯制造的广域连续杀人事件。警视厅联合各县警署召开联合搜查会议，毛利小五郎作为特别顾问而加入。事件中的有着诸如麻将牌的含义、第六名被害者死前遗言“七夕……今……”的含义、被害者的共同点、每名被害者都有一样物品被拿走等等谜团。会议结束后，柯南得知山村警官听到了某名警察用手机发送邮件时出现了类似《七之子》的按键声（即黑色组织头目的邮件地址），于是连忙追出，发现那名警察乘坐琴酒的车离去。

工藤新一，米花高中二年级学生，与小兰是青梅竹马，两人感情很好。继承了父亲的超强推理能力，被誉为高中生名侦探。他喜欢看推理小说，最崇拜福尔摩斯，另外踢足球的水平也是一流。不幸被卷入黑衣组织的交易被灌下毒药APTX4869，但是没有死，只是变成了小孩，改名江户川柯南（取自两个侦探小说里的人名）。幸亏智力没有衰退，还可以帮着毛利小五郎办案以寻找黑衣组织的线索，而体力上的不足靠阿栗博士的发明来弥补。变小后就读于米花小学1年纪B班，认识了步美、元太、光彦三人，还成立了少年侦探团。不管是变小前后，都是音痴，唱歌走音非

有一天众多企业在米花市政大楼，共同进行了一种新的游戏“茧”的成果发表会。玩家可透过这个游戏，进入虚拟世界中，体验实地游玩游戏的快感。r但是在这个同时，汤玛斯辛多拉董事长基于某些动机，杀害了工藤优作的朋友樫村忠彬，后来被揭发罪行。r在另外一边正式启动的“茧”，被泽田弘树所开发的诺亚方舟程式入侵，使整个游戏变成了一场生存游戏。眼看着未出局的人数越来越少，柯南如何挽救50个人的性命呢？......

专针对警察的连续杀人案件发生了，警察内部引起巨大的回响。对于想得到案件情报的小五郎，目暮警部却意外地守口如瓶。看到如此情况的柯南，联想到事情可能和警察部有莫大的关系。然后，下一个被枪击的目标居然是佐藤刑警!刚巧在案发现埸出现的小兰受到案件的刺激而被弄至失忆!犯人为了杀人灭口，于是企图把唯一的目击证人杀害!深知情况严重的柯南，为了保护小兰，不惜孤身犯险去把犯人找出来!

工藤新一，米花高中二年级学生，与小兰是青梅竹马，两人感情很好。继承了父亲的超强推理能力，被誉为高中生名侦探。他喜欢看推理小说，最崇拜福尔摩斯，另外踢足球的水平也是一流。不幸被卷入黑衣组织的交易被灌下毒药APTX4869，但是没有死，只是变成了小孩，改名江户川柯南（取自两个侦探小说里的人名）。幸亏智力没有衰退，还可以帮着毛利小五郎办案以寻找黑衣组织的线索，而体力上的不足靠阿栗博士的发明来弥补。变小后就读于米花小学1年纪B班，认识了步美、元太、光彦三人，还成立了少年侦探团。不管是变小前后，都是音痴，唱歌走音非

主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、