故事的主角里见孝太郎，在高中入学前因为父亲调职而开始一个人生活。孝太郎租下了房租每月五千日币，免押金、礼金，价格特别便宜的屋龄25年公寓，可乐娜庄的106号房，决定住进这间只有三坪（六榻榻米）大的房间开始新生活。但106号房却是间因为闹鬼，从来没人能久租的房间。开学典礼当晚，谣传中的幽灵――东本愿早苗出现在孝太郎面前。早苗主张是她先开始住在106号房，在双亲回来之前必须一直等在这里，而想把孝太郎赶出房间。两人争了一个晚上没有结果而暂时休战，没想到隔天自称魔法少女的虹野由莉佳破窗而入，再过一天又出现号称古代

剧中描述木幡真琴是一个15岁的魔女，她带着黑猫、搭着火车从横滨来到日本东北地区的青森，开始进行魔女的修练。她住进了远房亲戚仓本圭、仓本千夏这一对兄妹的家，也转学到当地的高中，开始在这座青森小镇里展开全新的生活。即使她现在的程度只能坐着竹扫帚飞上天，但还是很努力地学习魔法。于是，一段看似非日常的温馨日常生活冒险就此展开。

「结果战争没有消失，但是有了变化，在人类默默进行无聊的彼此杀戮之中产生变化。」超大型武器OBJECT，它的出现改变战争的一切。这种新武器一出现，立刻改写过去的战争常识。甚至有人表示如果手上有大量兵力，与其命令他们直接上战场厮杀，不如用来整备最强的OBJECT，让投入战场比较有意义。战车、战斗机这些过去战场上的主角，全都被当成"旧世代武器"。至于普通的机枪、炮弹、飞弹等等，简直和玩具枪没什么两样。派遣来到战场留学的学生库温瑟，在整备基地与OBJECT操纵者

幽灵、扮装少女、地底人、外星人、武艺高强的房东…这就是围绕在高一新生里见孝太郎身边的美少女军团。不过可别以为孝太郎过著置身天国的粉红色生活，其实这五名美少女正是他的烦恼来源。