当熊猫阿宝为成为真正的神龙大侠做准备的时候，他的生父——熊猫李山突然到访。与此同时，拥有神秘力量的反派天煞登场，妄图制服所有高手，统治武林。相传在与世隔绝的熊猫村有着对抗天煞的力量，为了拯救苍生，阿宝与父亲踏上了归途，而阿宝的好伙伴悍娇虎、金猴、灵蛇、螳螂则一同拖延天煞，阿宝不仅肩负着成为真正的熊猫大侠的使命，还要让村民美美等新伙伴练就新功夫，继承乌龟大师的遗志，共同抵挡天煞。

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熊猫阿宝终于美梦成真成为了神龙大侠，跟随功夫大师与盖世五侠：悍娇虎、猴王、快螳螂、俏小龙、灵鹤一起保护着和平谷、过着宁静的生活。然而，好景不长，有个邪恶的坏人沈王爷Lord Shen正打算用无人能挡的机密武器征服中国并且毁灭功夫，阿宝面临着一次新的、更加可怕的挑战，在羊仙姑的指引下，他必须回首过去并揭开自身的生世之谜，才能找到打败敌人的致胜关键力量。

基于Alexandra Bracken所著同名畅销青少年小说，讲述在一场疾病夺走了美国98%的儿童的生命后，剩余的2%发展出了超能力，他们被安置在拘留营中。一名16岁女孩逃离了营地，加入一群青少年的团队，躲避政府的追捕，踏上奇幻冒险旅程。